Un carro de esclavos, que seguía un camino, pronto se ve asaltado por unos bandidos, los bandidos iban asesinando a todos uno por uno. Llegaron ante un niño que intentó plantarles cara. Ellos se disponían a matarlo pero las hermanas lo defendieron hasta que los bandidos las mataron. Un hombre llegó matando a tres de ellos con un ágil movimiento de su katana. El bandido que iba a matar al chico, se lanzó a por el hombre, pero con la misma rapidez, fue derrotado. Prosiguió su camino, y el joven, el único superviviente, lo prosiguió también.

Al tiempo el hombre volvió a toparse con el chico, el que había cavado tanto las tumbas de los esclavos y de su familia, como el de los bandidos que los atacaron. El hombre le preguntó su nombre. A esta pregunta el chico contestó Shinta, le dijo que era un nombre muy amable para un samurai, y se le cambió por Kenshin. Después él se dio a conocer como Seijuro Hiko y decidió aceptarlo como aprendiz de su técnica con la katana.

Tras años de aprendizaje, Kenshin salió del monte donde entrenaba en busca de defender a los débiles y traer una nueva era.

Un hombre llamado Kogoro Katsura lo contrató como asesino.

En uno de sus asesinatos se topó con un hombre a punto de casarse y que tenía muchas ganas de vivir. Kenshin lo mató pero a cambio este le hizo una herida en la mejilla izquierda que no dejaba de sangrar.

Tras continuar con más asesinatos, en una ocasión, otro asesino le tendió una emboscada. Kenshin logró derrotarlo, pero una mujer resultó manchada de sangre y vio la batalla.

Tras unos instantes de duda, decidió perdonarla al ver que estaba ebria. La llevó a la posada donde el se hospedaba. Allí la mujer se puso a trabajar. Más tarde se presentó como Tomoe Yukishiro.

Kenshin le dijo que regresara a su casa, a lo que ella contestó que no tenía familia, nada más que un gato.

Un día Kenshin y Tomoe salieron a beber algo, pero Iizuka, un compañero de Kenshin, les avisó que tenían que huir de allí. Comentó que iban a prender fuego a Kioto y que Katsura estaba en peligro.

Al llegar al punto de reunión, encontraron a Katsura y este les dijo a Kenshin y Tomoe que les prepararía una casa donde ambos vivirían como marido y mujer en la montaña Yoishato.

Al principio tan solo se hacían pasar como marido y mujer, después se hicieron pasar por farmacéuticos que vendían medicinas de forma ambulante por los pueblos del alrededor. Más tarde comenzaron a sembrar su propia cosecha. Kenshin disfrutaba de esa nueva vida.

La alegría no duró ya que un día Tomoe, mientras Kenshin dormía, se marchó.

Cuando Kenshin se despertó, Iizuka entró por la puerta y le dijo, que la espía era Tomoe y que la prueba era el diario.

Kenshin comenzó a leer el diario; la herida de su mejilla, que tanto tiempo había dejado de sangrar, comenzó a sangrar de nuevo. Después le dieron orden de matarla.

Kenshin se encaminó hacía donde se encontraba Tomoe. En el camino le salieron varios enemigos que le hirieron, pero logró derrotarlos, llegando hasta su jefe y hasta donde se encontraba Tomoe. Kenshin iba perdiendo en la batalla, pero en una de sus acometidas, Tomoe se puso en la trayectoria de la katana de Kenshin, resultando herida de muerte, pero a la vez salvando la vida de Kenshin.

Esta, ya en su lecho de muerte y con la daga en la mano, le hizo una herida a Kenshin que cruzaba la anteriormente hecha en su mejilla izquierda. Después de decir unas palabras, cayó muerta, y Kenshin rompió a llorar.

Él la llevó a la casa donde ambos vivían. Katsura apareció diciendo que se había erradicado al verdadero espía. Tras una conversación, Kenshin prendió fuego a la casa y se fue.

Prosiguió luchando para conseguir traer una nueva era en la que nunca mataría a más personas, tal y como quería Tomoe.