Basado en una novela de Kinoko Nasu, escritor de TYPE MOON. Kara no Kyoukai juega en un universo paralelo al de Tsukihime. Considerado el precursor / inspiración para la historia de Tsukihime.

Despues de un largo sueño, se despertó Ryougi Shiki.
Como resultado, ella obtuvo el poder de percibir la muerte de las cosas.
Un poder de matar cualquier cosa con solo un cuchillo, atrae a Shiki hacia un mundo oscuro.
El asesino de hace dos años.
Enjambre flotante de fantasmas
Una niña que puede doblar las cosas por tan sólo mirarlas.
Una espiral de construcción que recoge la muerte de personas.
Cuando numerosos extraños incidentes chocan con los ojos misticos de Shiki su pérdida de memoria regresa.

El personaje principal, Ryougi Shiki, estuvo involucrado en un accidente de automóvil y cayó en un profundo coma durante dos años. Cuando finalmente se despertó, había ganado la abilidad "Percepcion de los Ojos de la Muerte ", pero cree que algo ha perdido tambien.

La familia Ryougi intentó crear seres humanos que superen a los seres humanos normales, y para lograr esto, capacitó a sus hijos en diversas artes marciales y esgrima, y también les hizo dividir su personalidad. Creían que mediante el uso de este método, una personalidad podría ser un experto en una materia mientras que la otra podría ser maestro de otras materias. Shiki no fue una excepción a esto, y ella tenía un lado masculino y femenino que cambiaban de lugar entre sí.

Después de haber despertado del accidente, Shiki cree que su personalidad del lado masculino había muerto durante el accidente. Ahora ella trata de suplantar el espiritu del lado muerto de su personalidad por su caracter masculino.